美国当地时间4月20日，自然出版集团发布最新的自然指数，Nature Index 2016，全面衡量全球各个国家/地区、科研院所、高等学校、以及产业机构的高水平论文产出，并评估各个院校在化学、地球与环境科学、生命科学、以及物理科学四个核心学科领域的排名。北京大学的综合评估高居全球第十一名，展现出世界一流大学的高水准，并在各个核心学科领域也表现出色，领跑中国高校。
国家与地区排名
在国家与地区排名之中，中国位居第二，从纵向比较来看，中国在增长，而美国在下降，双方差距在缩小。德国、英国、和日本名列五强。
全球大学排名
在去掉各个国家科学院系统的全球大学排名之中，哈佛大学高居榜首、斯坦福大学排名第二，日本东京大学挤进前三，麻省理工学院和牛津大学分别排在第四和第五。前十名中还有瑞士理工。北京大学排名全球第11位。进入全球50强大中国高校，还有南京大学、清华大学、中国科技大学，浙江大学、复旦大学和南开大学。
全球化学排名
化学一直是中国的传统强项。北京大学化学学科排名高居全球第四。此外还有中国科技大学、南开大学、清华大学、浙江大学、复旦大学排名前25，厦门大学、湖南大学、华东理工大学、苏州大学、吉林大学、四川大学、武汉大学排在世界50强。
全球物理科学排名（Physical Science）
在全球物理科学排名中，北京大学物理学科排名高居世界第13位，位居中国高校之首。此外还有清华大学、中国科技大学、南京大学、复旦大学、浙江大学和苏州大学上榜，显示出中国高校在物理科学领域的雄厚实力。
除此以外，北京大学生命科学学科排名居全球第75位，同样也高居中国高校榜首。
