公共卫生学院李立明教授主持的项目“环境与遗传因素及其交互作用对冠心病和缺血性脑卒中影响的超大型队列研究”获得2013年国家自然科学基金重大项目资助（81390540），金额为1800万。这是国家自然科学基金委员会自组建后设立的第一个公共卫生领域的重大项目。
冠心病和缺血性脑卒中已经成为威胁我国人群健康的两种重要的动脉粥样硬化性心脑血管疾玻多年研究对冠心病和缺血性脑卒中两种疾病的一些危险因素已经得到证实，并在此基础上构建了个体心血管病风险预测模型；但是这些模型的预测能力仍然有限。围绕着这两种疾病的病因和致病机制仍需要开展更多深入的研究，发现及确证更多新的遗传和环境危险因素，并探讨因素之间复杂的交互作用。现有多数与这两种疾病有关的病因学证据都来自西方发达国家人群，由于中国人群无论在遗传背景还是生活方式习惯、环境背景等都与西方发达国家人群存在巨大差异，这些证据及在此基础上构建的疾病风险预测模型、推荐的防治措施是否适用于中国人群，仍有待确证。国内虽然也开展有相关研究，并构建有风险预测模型，但所基于的研究规模较校我国亟需本土化的基于大样本量的、高质量的病因学证据。
该重大项目的工作基础是李立明教授作为项目负责人开展的中国慢性病前瞻性研究项目（China Kadoorie Biobank, CKB）。CKB项目建立了中国目前最大规模的超大型自然人群队列（50余万人）；覆盖我国东北、西北、华东、华南和西南具有不同经济发展水平、社会文化背景以及暴露谱和疾病谱的城市和农村地区；与当地发病和死亡监测系统有机整合，极大的提高了疾病监测能力；建立有生物样本库；引入国际先进的管理理念和技术手段，采用自动化的信息采集系统和生物储存管理系统，坚持标准化操作规范是研究质量的重要保障；而超大规模的人群队列为有效开展各种常见并多发病和部分罕见病的病因学研究提供了重要的保证。
该重大项目分为四个课题：基于中国超大型队列的冠心病和缺血性脑卒中及其危险因素的长期趋势和病因学研究，基于中国超大型队列的冠心病和缺血性脑卒中遗传易感性研究，基于中国超大型队列的冠心病表观遗传学研究，基于中国超大型队列的冠心病和缺血性脑卒中发病风险预测研究。该项目分别以这两种疾病为主题，拟在未来的5年时间内，通过利用以超大型人群队列为基础开展的长期死亡和发病监测及定期的随访调查，描述我国不同类型地区、不同特征人群中冠心病（CHD）和缺血性脑卒中（IS）及其主要危险因素的长期变化趋势；开展前瞻性队列设计的病因研究，分析传统明确的以及新关注但尚不明确的生物学、行为、心理、社会等危险因素及特殊暴露对中国人群中CHD和IS发生风险的独立作用和复杂的交互作用；进一步采用基于队列的巢式病例—对照设计，探讨CHD和IS的遗传学和表观遗传学机制。合理的先因后果的时序性，病例和对照来自相同的源人群，使得本项研究具有以横断面设计和病例对照设计为主的独特优势，得到的证据强度更优，且对中国人群的适用性更强。在上述研究的基础上，尝试构建适用于中国人群的心脑血管疾病风险预测模型，并为制定国家防治策略与措施、更新疾病防治指南、更有效地识别高危人群，为中国患者提供高质量的病因学证据。
